王杰

  • 博士,博士生导师
  • 办公室:A134
  • 研究员,器官再生的表观组学与生物信息学研究组
  • 电话:020-32015209
  • 研究组长,中科院再生生物学重点实验室
  • 电子邮箱:wang_jie01@gibh.ac.cn
个人简介
2014年在中国科学院上海生命科学研究院获得生物信息学博士学位;2020年在约翰·霍普金斯大学医学院 (Johns Hopkins University School of Medicine) 完成博士后研究;现为中国科学院广州生物医药与健康研究院研究员。
研究兴趣
长期针对生物组学、临床病理等大数据进行统计建模、机器学习、网络重构等生物信息学方法开发与应用。课题组主要通过单细胞测序等组学检测技术进行疾病与器官再生的表观调控、生物信息学研究。
1. 建立单细胞测序相关的数据库并开发新的组学分析方法。
2. 多组学和生物信息学研究疾病与器官再生的表观调控机制。
3. 构建疾病发生与器官再生的多维数学模型,并进行相应的模拟与预测。
发表论文
(代表性5篇)
1.Hoang T#, Wang J#, Boyd P, Wang F, Santiago C, Jiang L, Yoo S, Lahne M, Todd LJ, Jia M, Saez C, Keuthan C, Palazzo I, Squires N, Campbell WA, Rajaii F, Payail T, Trinh V, Kim DW, Wang G, Campbell LJ, Ash J, Fischer AJ, Hyde DR*, Qian J*, Blackshaw S*. Gene regulatory networks controlling vertebrate retinal regeneration. Science 370, 934 (2020). 
2.Wang J#, Zibetti C#, Shang P, Sripathi SR, Zhang P, Cano M, Hoang T, Xia S, Ji H, Merbs S, Zack D, Handa JT, Sinha D, Blackshaw S*, Qian J*. ATAC-Seq analysis reveals a widespread decrease of chromatin accessibility in age-related macular degeneration. Nature Communications 9, 1364 (2018).
3.Yuan S#, Wang J#*, Yang Y, Zhang J, Liu H, Xiao J, Xu Q, Huang X, Xiang B, Zhu S, Li L*, Liu J*, Liu L*, Zhou W*. The prediction of clinical outcome in hepatocellular carcinoma based on a six-gene metastasis signature. Clinical Cancer Research 23, 289-97 (2017).
4.Yuan S#, Wang J#, Yang F#, Tao Q#, Wang L, Yang Y, Zheng H, Wang Z, Xu Q, Wang F, Liu L*, Sun S* and Zhou W*. Long noncoding RNA DANCR increases stemness features of hepatocellular carcinoma by derepression of CTNNB1. Hepatology 63, 499-511 (2016). ESI Highly Cited Paper (> 200 citations).
5.Wang J, Xia S, Arand B, Zhu H, Machiraju R, Huang K, Ji H, Qian J*. Single-cell co-expression analysis reveals distinct functional modules, co-regulation mechanisms and clinical outcomes. PLOS Computational Biology 12, e1004892 (2016).
 
个人履历